有学员说,在孟德尔随机化文章中,看到一些文章的森林图和自己做的不太一样,自己使用TwoSampleMR包绘制的森林图,并不是很美观,问陈老师,这么漂亮的森林图是如何绘制的?
其实,在孟德尔随机化文章中,森林图主要出现在单个SNP的效应值及不同合并方法总的效应值绘制中。
单个SNP效应值森林图在TwoSamplemr包可以直接绘制。
不同合并方法总的效应值就不能直接生成森林图,需要抓取一些信息,再单独绘制。
所需要的信息有:
采用的方法,如IVW,MR Egger等
效应值:OR值、回归系数
效应值95% 置信区间
诸位收集以上的信息,可以通过R语言中forestplot包进行绘制,具体绘制方法可以借助AI工具,在deepseek中搜如何利用forestplot包绘制森图,获得代码,就可以绘制精美的森林图了。
这个统计问题就解答到这里,大家可以关注我们的公众号“医学论文与统计分析”,我们将分享更多统计学知识!