第二段 伟大航路之SKY PIEA篇
加亚篇（动漫：131－152话）
离开阿拉巴斯坦王国之后，想要前往下一个岛的草帽一伙意外发现一艘从天而降的大船。 诡异的是，纪录指针竟然向上指向天空。
路飞也在大船上找到一张“空岛”的地图，先前没有预料到会有如此状况的一伙人来到了加亚岛，路飞、佐罗、奈美三人前往岛西“魔谷镇”镇上的酒吧，想要打听有关“空岛”的线索，但遭到“鬣狗”贝拉密及其海贼团一伙人嘲弄。
贝拉密等人对路飞拳打脚踢，甚至讥笑所谓的“空岛”只不过是白日梦而已，但路飞对佐罗说“这场架打不得”，以毫不还手诠释了他对梦想的坚信不疑。
在酒吧外的“黑胡子”马歇尔·D·汀奇后来跟奈美解释：“这场胜负是你的伙伴赢了”，接着透过罗宾从魔谷镇得来的情报得知，加亚岛有个被居民逐出魔谷镇的怪老头库力凯，他似乎知道到达空岛的方法。
从岛西的城镇离开后，他们来到加亚岛东部的海岬，遇到了四百年前被称为骗子的蒙布朗·诺兰德的子孙－猿山联合军船长 蒙布朗·库力凯，得知了上升海流下次的爆发地点在加亚岛南方后，全员前往森林想要捕捉一只名叫指南鸟的生物帮忙指引方向，回来后却发现库力凯的黄金遭到先前发生冲突的贝拉密强夺。
虽然离出航时间只剩三小时，路飞还是冒着可能赶不上上升海流的风险，一个人跑到魔谷镇，一拳击倒了贝拉密并且抢回黄金。 之后一行人前往上升海流的预定爆发地点，出发前往空岛。
路飞一行人离开魔谷镇后，“王下七武海”之一的唐吉诃德·多佛朗明哥现身，操控贝拉密一伙人当中的“大匕首”萨奇斯，将身为手下却失职而玷污了自己名誉的贝拉密杀死。
第二段 伟大航路之空岛篇
空岛篇（动画：153－195话）
乘着上升海流，一行人来到了海拔一万米高空的“白海”。 他们发现空岛并不只是原本他们想像的黄金乡而已。 大伙原本冀望能够在空岛享受不用担心海军的愉快时光，却莫名其妙被冠上了“非法入国”的罪名，被迫接受“神之岛”阿帕亚多上四神官们的“试炼”考验。
在试炼的过程当中，众人根据分头探索的经验得出了结论：四百年前，诺兰德口中的黄金乡并不是沉没到海底，而是因为上升海流的关系使原本的加亚岛一分为二，一半到了这“白海”上── 也就是说，这神之岛就是原本的加亚，而那只有一半的房屋更是支持这个推论的铁证。
前任的神“天空骑士”甘·福尔则是因为从一伙人得知了阿帕亚多的来由，明白了岛上天使们和香狄亚人四百年的战乱的来龙去脉。 另一方面，拥有自然系“轰雷果实”能力的“神”艾涅尔，在神之岛设计了一场81人的生存淘汰赛，并且预言能存活下来的只有5个人。
草帽一伙在黄金前夜祭后，决定分成2组行动：由奈美、撒谎布、山智三人驾驶前进梅利号找寻可以离开空岛的的出口；路飞、罗宾、佐罗、乔巴四人则组成“黄金探险队”在找到黄金后和其他人会合，但却因为被突然出现的大蛇攻击而分散，开始了各自的冒险和战斗。
经历与其余74名参赛者的激战，三小时后，罗宾、佐罗、奈美、福奇，以及香狄亚战士瓦夷帕等五位参赛者出现在艾涅尔面前，艾涅尔为了让自己的预言准确，亲手剔除了第六名参赛者甘·福尔，同时也娓娓道出自己的目的。
其实他真正的计划是打造一艘大型飞船方舟“箴言”，并带着来自古早香狄亚人打造的巨大黄金钟楼前往“无限大地”，同时将空岛打回青海，参赛者们得知后纷纷站出来反抗艾涅尔，却都败在那无敌的雷能力之下。唯一幸存的奈美为了保命，假借自愿跟随艾涅尔前往“无限大地”，一方面找寻逃生的机会，原以为计划完美无缺的艾涅尔却漏算了被大蛇吞下肚的路飞。
不久路飞逃出大蛇身体，看到伙伴们的惨状气愤不已，当下冲向艾涅尔停靠方舟的地方，巧合的是由于空岛没有“橡胶”，路飞不导电的橡胶体质反成了艾涅尔最棘手的天敌，两人纠缠了好几回，艾涅尔最终仍被击败。
路飞也敲响了巨大的黄金钟，让天空的住民们听到四百年前的“岛的歌声”重现，终于解开了两族的心结，也终止了长达四百年的战争。 同时，因为罗宾解读了历史本文的文字，明白了原本香狄亚人守护历史的任务已经该交给对历史有所认知的自己，香狄亚人的历史包袱也就能够放下。
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